1985年7月1日，香港基本法起草委員會舉行第一次全體會議之後，基本法的草擬工作正式展開。在基本法的起草過程中，曾經出現過不少爭議。

據當時的基本法起草委員會秘書長，亦是國務院港澳辦副主任李後在1997年所撰寫的回憶錄，從第二次全體會議以後，起草委員會的工作，進入分組起草條文的階段，每個專題小組每草擬出一條條文，都經過充分討論，不同意見可以充分發表，並得到尊重。不同的意見並列在草案之中，或者以「附記」的形式附在主流意見後面，呈交大會討論。

各方面普遍關注的，是基本法中如何規定中央與特別行政區關係，如何劃分中央與特別行政區的職權。

1987年4月，鄧小平在會見參加第四次全體會議起草委員的時候，發表過講話：

「我們的社會主義制度是有中國特色的社會主義制度。這個特色，很重要的一個內容，就是對香港、澳門、台灣問題的處理，就是一國兩制，社會主義國家裏面，允許一些特殊地區的資本主義，不是弄一段時間，而是弄幾十年，上百年。另一方面，亦要確定整個國家的主體是社會主義，否則，怎可以說「兩制」呢？那就變成「一制」了。千萬不要以為香港事情全部由香港人管，中央一些也不管，就會萬事大吉，這樣是不可以的，這種想法不實際。中央確實是不干預特別行政區的具體事務，亦不需要干預。但是，在特別行政區是不是亦都會發生危害國家根本利益的事情呢？難道不會出現嗎？到這時北京過不過問？如果中央將所有權力都放棄，就可能出現一些混亂，損害香港的利益。所以，中央保持某些權力，對香港有利無害。」