蔣介石 打算將台灣當作 國民黨 最後的據點，從 國民黨 的叫法，稱為「 反共復國基地 」。但是，在 1949 年 國民黨 領導層剛到達台灣時，台灣的情況十分混亂。

台灣當時是一個農業社會，大批難民從海峽對岸湧到，他們急需解決就業、就學、居住、衛生等問題。而且大陸難民和台灣本土人之間，無論是語言、生活習慣、甚至意識形態方面，都有明顯的差距。因此，國民政府遷台初期，社會問題十分嚴重。

其次， 國民黨 在大陸時期派系非常複雜。 蔣介石 雖是 國民黨 最高領袖，但在各地各省分佈了不少地方勢力，這些非 蔣介石 嫡系的部隊都擁有武器，令 蔣介石 十分頭痛。此外，不少 國民黨 不同派系的官員雲集台灣，等待國民政府安置。

更嚴重的是，以美國為首的「自由世界」反共陣營國家，對退守台灣的國民政府並無積極支持。英國率先在 1950 年 1 月初，表示願意確認中華人民共和國政府，而美國亦尋求與北京建立關係。

不過，韓戰爆發後，情況起了變化，台灣成為美國圍堵共產陣營的戰略環節，美國第七艦隊開入台灣海峽，美國總統艾森豪威爾訪問台灣，而國民政府在美國支持下，保有聯合國的中國席位及安全理事會常任理事國席位，鞏固了 蔣介石 的政權。

1950 年 3 月， 蔣介石 宣布恢復執行中華民國總統職務，亦即所謂「總統復行視事」，任命陳誠為行政院院長、蔣經國為國防部總政治主任，並在 1954 年成立國家安全局實施戒嚴法，修訂「全國動員戡亂時期懲治叛亂條例」，擴大軍、警、憲兵、特務權力。