第二集尋蹤抗戰歷史將以香港的淪陷經過，以及東江縱隊港九獨立大隊在西貢及沙頭角的抗戰經歷為主線，遊歷具歷史價值的遺址，同時亦可感受珍貴的自然生態環境，如淡水沼澤、溪流、紅樹林等，可讓公眾在欣賞鄉村自然風光之餘，同時了解香港淪陷期間的抗戰歷史。

香港淪陷期間，香港地下黨組織及廣東人民抗日游擊隊展開空前絕後的「秘密大營救」，在日寇嚴密封鎖下，救出數百文化人士，轉移往後方安全地帶，奇跡般地完成一場「最偉大的搶救工作」。
第一集尋蹤抗戰歷史以「秘密大營救」為主題，介紹七個與「秘密大營救」有密切關係的地點，對比現今變化，了解背後的歷史故事及旅遊價值，並感受抗戰勝利的艱辛，反思現代和平生活得來不易。