眾人再次來到案發現場邱行長家，專家組重建現場、重驗物證，但卻未發現新線索。秦川提出四連指指紋是突破的關鍵，需重新組織指紋採集。秦川安排郭嘉琦留下落實打指紋的事情，曹忠恕先回緒城，其他人隨他前往林城市東林縣，調查2010年東林縣三名小學女生被害的案件。

秦川聽完大家訴說清江兩案的經過後，決定退掉回省城的機票，去看案發現場。退休的蔣繼忠專門前來，請求秦川在有生之年破案，眾人動容。因此，秦川決定在全省範圍內開展一次疑難案件攻堅，解決積案冷案問題。秦川帶著劉林等人前往清江，曹忠恕也從緒城出發與眾人匯合。

海平追加了兩輪測試，李田終於暴露，基本可以確定他殺害了朱玫玫，他如實招供並帶領警員指認埋屍地點。2016年，秦川再度來到清江複盤案件，眾人向秦川講述了“清江兩案”的歷史，指出當年專案組花費巨大心血調查命案，但八年來都未有突破，一轉眼18年就過去了。

在預審員老楊的勸導下，廖文虎終於供述了犯罪過程。案件能在軍令狀限期破獲，秦川露出了笑容。秦川離開清江時，顧文龍提起了清江兩案，希望秦川能來破這個案件，秦川保證還會回來。同時，海平已到培興市局刑偵支隊技術大隊正式入職，專攻心測，參與了一宗女性失蹤案件。

秦川請來了電子工程學葉教授，確定了遙控器是電單車雙向遙控器，價格高且少見，應能找到買家。秦川立即要求查遙控器的銷售記錄，並進行了多次摸排。最後，楊雄和龍翔在西水縣從一間電單車維修鋪老闆得知曾有兩個人來買了同款遙控器。經翻查視頻後，最終發現了嫌疑人。

郭嘉琦建議通過懸賞發動群眾舉報炸藥來源。一名採石場的司機舉報，稱兩箱炸藥在爆炸案發生前被盜，但卻不知誰偷了炸藥，線索再次中斷。幹警們持續摸排，但毫無進展，秦川決定留在山上過年。年後，秦川下令擴大搜索範圍，終於找到了一個完整的遙控器，大家都歡呼雀躍。

秦川認為犯罪嫌疑人可能混在賭徒中，必須從賭場情況入手。警方在案發現場附近找到家中藏有雷管、炸藥的阿金，然而經審訊後，秦川判斷他不像疑犯。秦川嘗試從現場遺留物入手，而曹陽等人則在爆炸殘原件上發現了女性DNA樣本，但這些線索皆無助破案，案件頓時陷入僵局。

警隊通過心測成功破獲槍擊案，海平因此對心測產生了興趣。此時，陶副廳長和秦川正參觀李文的資訊情報中心，李文通過資料分析更快破獲了一宗命案，就此雷主任決定開班講解新舊刑偵技術的應用。2014年1月，清江市野外賭場發生爆炸案，秦川對案件偵破提出了系統分析。

面對民警的圍堵，張克寒開槍射擊，雙方展開激烈槍戰，最終他被擊斃。案件告破，秦川和武英德感到前所未有的舒心。此時，家宴中李文宣佈海平將考雅思出國，海平卻在考雅思當天去了公務員考場，如願成為了一名警員。海平隨即到高新分局見習報到，參與了一宗槍擊案的調查。

2012年8月，昀城松樹坪中安銀行發生槍擊案，秦川迅速判斷出是張克寒所為，並實施佈防追捕。張克寒逃竄過程中又槍殺了鐵警，警方四處張貼通緝令，隨即在大順商場發現他的行蹤。秦川決定以松樹坪附近的墓地作為佈控點，分三線佈防，務求在張克寒再次作案前抓捕他。

審訊室內，張克寒妻子蔡玉琴供述了他是槍殺哨兵案的兇手，一直是獨自作案，不用手機，住在墳地裡。另一邊，張克寒逃至浮城，在一家洗浴中心遇到蔣美珍，並以金錢誘惑她。此時，秦川提議召集專家重新勘查張克寒落腳點，經過反覆的刻畫，他推測張克寒可能會回到昀城作案。