第二集尋蹤抗戰歷史將以香港的淪陷經過，以及東江縱隊港九獨立大隊在西貢及沙頭角的抗戰經歷為主線，遊歷具歷史價值的遺址，同時亦可感受珍貴的自然生態環境，如淡水沼澤、溪流、紅樹林等，可讓公眾在欣賞鄉村自然風光之餘，同時了解香港淪陷期間的抗戰歷史。