秦川被調往緒城市擔任市局刑偵支隊支隊長。東萍縣公安局局長緊急前來請求秦川去指導辦案一宗五年未破的婦女兒童被殺案。由於證據鏈不夠完整，犯罪嫌疑人兩次被收押後都釋放了。秦川要求拿出案子的副卷，發現當中有半枚血指紋，便找來專家曹忠恕鑑別，兇手原來另有其人。

秦川得知胡兵為了追逃犯出了意外，悲從中來，與胡兵徹底釋懷。2000年春節，刑偵專家武英德到緒城市局講課，與秦川就松林縣一個案件進行了一段激烈的討論，更收了秦川為徒。此時，葉茂生的案子又起了變故，秦川向武英德求助，從中對作為執法者又有了新的領悟。

秦川審訊了王五，他交待偷糧團夥的頭是李埋伏。秦川帶人來到李國英家，發現牆上的日曆上有一個電話號碼。秦川根據電話號碼找到了一個叫順天福的飯店，在一番探查下，發現一群人正在院子裡挖地道，原來是一團盜賊，盜賊的頭目就是李國英。秦川請來當地民警協助抓捕盜賊。

秦川辦理郭鳳英案時，被河昌市檢察院柴雲平要求把郭鳳英捐給鎮政府的三萬塊贓款追回來。秦川帶人去古慶鎮政府要回贓款卻遇冷釘子。秦川讓內勤假扮記者成功追回贓款，又在郭鳳英堂弟郭強找到了票據，破獲了案件。隨即，秦川又被邀請幫紀委查一宗盜竊國家儲備糧庫案。

葉茂生深夜回家時偶遇一名偷車賊，上前阻止卻遭偷車賊開槍後逃跑。葉茂生重傷不治，犧牲在寒夜裡。犯罪嫌疑人牛玉國被緝拿，卻因沒有屍檢報告被檢察院退卷。秦川找到專家給出彈道測試報告，法院最終判處牛玉國死刑。此後，秦川也開始回到正軌，開始主持預審科的工作。

案子告破，刑偵總隊幹部趙飛來到河昌慰問大家，趙飛與秦川等人結下友誼。戴長江告訴秦川，市里和局裡要給秦川請功，他還想把跟秦川有矛盾的胡兵調走，可是戴長江因為職務變化，也離開了西山分局，不好再插手。最後，韓敬東提出讓秦川和胡兵皆調離西山分局。

白玲的招供為審訊打開了重要的突破口。1992年路南礦發生的一起搶劫案，與白玲交待的情況相符。當戴長江讀出白玲的口供，孫哲的心理防線被擊潰，承認是自己和宋小軍、陳小秋、陳小冬一起做的案。最後，宋小軍終承認自己殺害了高建設，如實交待了自己所有的罪行經過。

專案組實施對犯罪嫌疑人宋小軍、孫哲及宋小民的抓捕行動。抓捕行動進行順利，專案組隨即展開對三人的審訊。三人回應神態自若，專案組無法得到任何進展，因此轉向從宋小軍妻子白玲尋找突破點。經過秦川一輪勸說後，白玲逐漸冷靜下來，說出了自己一直以來對宋小軍的懷疑。

專案組就犯罪嫌疑人宋小軍、孫哲及宋小民進行抓捕行動。抓捕行動順利執行，專案組隨即展開對三人的審訊。三人回應神態自若，審訊無法得到任何進展，故轉向從宋小軍妻子白玲尋找突破點。經過秦川一輪勸說後，白玲逐漸冷靜下來，說出了自己一直以來對宋小軍的懷疑。

曹忠恕及專家組研究推斷，11號無名屍是保衛幹部張義文在臨死前打中的一名犯罪嫌疑人，並推斷其左眼有明顯特徵。秦川指出1991年金鹿儲蓄所搶劫案中的一名犯罪嫌疑人亦有類似的眼部特徵，且此案與高建設案有關，提出併案。專案組根據線索，重點排查後鎖定嫌疑人。

河昌市公安局大山子派出所副所長高建設於1991年遇害，但四年過後案件仍未偵破。此時，秦川剛從省城大學畢業，主動要求回到河昌市，成為西山分局刑警隊副隊長，勢要破獲此案。然而，就在秦川報到當晚，四名匪徒到西山煤礦搶劫工資款，殺害十人，秦川趕去案發現場。